кариотипирование от цитогенетики отличается только исследуемым материалом: у рожденных людей для анализа берут кровь (и анализ кариотипирование), а у плода просто исследуют материал (крови то еще может нет своей; и анализ цитогенетика). в остальном это синонимы.