Без проблем смотаетесь, главное въехать в Эстонию и чтобы был мультишенген на всякий пожарный.
Шенгенскую визу выдает посольство того государства, в которое ты едешь, а оттуда имеешь право ехать в др. страны шенгенского соглашения.
Насчет визы - на ней проставляется посольство государства, выдавшего её. Так что, хоть она и единого образца, а различия все равно есть. Удачи!