вся фишка в том, что деньги вам перечислят после регистрации договра купли-продажи, надеюсь речь о Москве? так что необходимо грамотно составить договор (в договоре прописать что покупается при помощи жил сертификата и куда будут перечислены деньги) и не подписывать акт передачи квартиры и неписать расписку о том что деньги получены пока деньги не будут получены, а так же могут быть вопросы с налогами если квартира менее 3-х лет в собственности