ИМХО что-то понял, что-то нет.
НО то, что вопросы задает - это хорошо. Значит есть контакт.
Тут важно, чтобы вы от него в молчанку-тайны не играли. А на все имели объяснение (пусть и на детском уровне).
И думаю, что забудется и не сильно его это "задело".

Помню, как мне было года 3-4. Дедушка умер. Взрослые "ушли" с контакта. Что-то недоговаривали (тогда было "модно" скрывать все от детей) и при этом ходили с такими страшными лицами, что мне было страшно-непонятно-ужастно. Я выдала температуру под 40 в июле месяце. Думаю, что это была ответная реакция.