http://deti-moskvy.ru/neskuchnye-muzei-dlya-detej/ если выбрать не мега популярные музеи то можно спокойно все посмотреть.
на самом деле если ехать часов в 12-14 то уже не так много народу. школьники едут с утра, мы от колледжа тоже с утра ездили и в час уже многие дома были.