По порядку:
1. Мы отдавали аванс 200 тысяч при предъявлении подлинников документов (со стороны продавца было агентство). У вас сообще кто представляет продавца - частный риэлтор или агентство? У нас была основная проблема в том, что аванс принимало именно агентство и давало нам не расписку, а гарантийное письмо о его принятии, и только на сделке мы стрясли-таки с них расписку на всю сумму аванса. Вообще я пришла к выводу, что более чернушные конторы, чем агентства недвижимости, надо поискать)).
По поводу сумм аванса - они реально разные, кто-то дает 50, кто-то 250. 500 - крутовато как-то, конечно. Тут, думаю, Дочка Варвара точнее скажет.
То, что это комиссия агента - вполне вероятно, в нашем случае это именно так и было.
Вам как покупателям лучше было бы прописать отдаваемую сумму как задаток, а не как аванс - тогда продавец в случае отказа от совершения сделки обязан был бы вернуть вам уплаченные деньги в двойном размере. Но покупатели, понятное дело, не очень-то охотно на это идут.
2. Ну тут та же схема, по сути, и риски те же, что с 1 млн - все, что вы платите сверх указанной в договоре цены, оформляется отдельной распиской.