Почему теряет, она идет по соглашению сторон, а не по собственному желанию? При расторжении трудового договора по соглашению сторон можно любую сумму указывать (не вдаваясь в подробности о локальных нормативных актах). И эту тоже. А будь приказ на отпуск, ни о каких прогулах уже речь идти не может и в трудовую (если автору ее не отдадут сейчас) никакую "плохую" статью не запишут.