по поводу трансферов, если на скоростном катере, то все катера принадлежат отелям, так что тут проблемы не будет с организацией. По поводу гидросамолетов, там 2 транспортные компании, как правило, отели также заключают с ними договора и сами же занимаются бронированием перевозки. Так что технически, думаю нет проблем забронировать наземку самостоятельно.
Другое дело - в какой период поездка, если высокий сезон, праздники, каникулы, то отели предпочитают раздавать блоки номеров операторам (еще бы, оптом и денежки вперед;0) Может пару номеров и оставляют для прямых продаж, но тогда уж сильно заранее надо бронировать.
Кстати, после майских у них т.н. низкий сезон начинается и длится до конца октября. Многие отели дают специальные предложения в виде бонусных ночей (живешь 10 ночей, платишь за 7 и т.п.), ну и забронировать в этот период намного проще.
Билеты, если это опять же не каникулы-праздники, проще ловить на регулярке. Катарцы частенько хорошие тарифы дают. Эмирейтс тоже можно смотреть. Не знаю, продает ли Аэрофлот свой прямой рейс в системе или только блоками. Еще кстати вариант билеты купить - прозвонить крупных блочников, ближе к делу могут и по себестоимости или ниже отдать. Блочники - крупные операторы. Мы так в свое время у мальдивианы по очень хорошей цене отхватили билеты.