Кишечная инфекция может быть и вирусной (ротавирус, например), и бактериальной (как сальмонеллез, например).
ИМХО, если самочувствие нормализовывалось на какое-то время, то это 100% не сальмонеллез, а остальные бактериальные инфекции (холера и иже с ними) все-таки редкость у нас, тем более зимой. Поэтому я была бы уверена, что это ротавирус, которым за последние два месяца полмосквы переболело (в том числе мы, с такими же симптомами, как у вас). Все строго ИМХО.