Есть такой музей образования (м. Павелецкая, Новокузнецкая). Там интересные экскурсии проводят для организованных групп. Различные любопытные опыты показывают.

И ещё есть что-то типа Экспериментариума. Не была, но отзывы слышала.

Ещё Бородинская панорама.

Планетарий.

Музей паровозов.

Музеи с динозаврами.

Но другой вопрос - возраст, с которого это всё может быть интересно.