Есть такой музей образования (м. Павелецкая, Новокузнецкая). Там интересные экскурсии проводят для организованных групп. Различные любопытные опыты показывают.
И ещё есть что-то типа Экспериментариума. Не была, но отзывы слышала.
Ещё Бородинская панорама.
Планетарий.
Музей паровозов.
Музеи с динозаврами.
Но другой вопрос - возраст, с которого это всё может быть интересно.