Конечно может. Тем более сейчас, когда 2 варианта оплаты по старым и новым правилам. По идее бухгалтер должен был выбрать тот, что выгоднее тебе.
Я вот ездила на работу больничный отдавать, тоже жалею что не взяла 2 ндфл, потому что у меня столько раз менялась зп, что какой вар-т отплаты мне выгоднее - непонятно...