Средний заработок работнику на время командировки сохраняется, проезд работника к месту командировки и обратно к месту постоянной работы оплачивается, возмещаются расходы по найму жилого помещения + выплачиваются суточные.
Размер суточных каждая компания устанавливает по своему усмотрению.
Вот отсюда почитай подробней (ну, про налогообложение можешь не вдаваться в подробности): http://www.buhonline.ru/pub/comments/2011/1/4152