во-первых, если у него была УВАЖИТЕЛЬНАЯ причина и он сможет её доказать (а ты ж пока этого не знаешь), то фиг ему выговор впаяешь.
во-вторых, как уже и написали, надо смотреть ЧТО в приказе написано, там четко должно быть прописано в мелочах, что и сколько и в какой срок надо сдать.
в-трутьих, ТОЧНО в суде не докажешь, что у вас прям без его части работы случилась попа-попа, это все-таки не к вашему типу организации относится. (это все расчетные величины - человеки/часы и проч, и суд в этих случаях всегда на стороне работника).

Да и не пойдете вы в суд, 100-пудово. Тут надо понимать - вы чего от этого сотрудника хотите? припугнуть дисциплинарным взысканием? так завсегда найдется и другой повод прикопаться, :-)))) если уволить - это другой вопрос.