Ну слушай, моя когда вынужденно свернули ГВ в полтора года - выпивала за ночь по полтора-два! литра смеси. Тоже только питье ее могло ночью успокоить. На почках это не отражалось никак, отразилось на весе - поправилась она тогда порядочно. В 2,5 года я с большим трудом заменила смесь разбавленным соком, но количество выпитого за ночь уменьшалось очччень постепенно. И в 3 года по 5 раз за ночь просыпалась, и в 4 пару раз, да и сейчас почти каждую ночь попить просыпается. Впрочем, моя вообще всегда несплюшкой была, так что не думаю что у вас это будет так же долго...
Что пьете ночью? Если воду или там слабенький компотик - имхо, не парься, пусть пьет. Если смесь/кефир/молоко - рискуете лишним весом, если сладкий компот/сок - риск для зубов, старайся делать концентрацию как можно меньше, но в общем если по-другому никак - я бы давала пить ребенку, не мучить же его.