Ох, вот это ситуация...., неприятная - мягкое слово...
Я бы поступила следующим образом: при встрече в лоб бы заявила помощнице, что пропал конверт с деньгами, вам не попадался, вы не переложили?
Посмотрела бы на реакцию.
Потом честно сообщила, что вы вынуждены обратиться в полиции, что понимаете все неудобство для всех, просите понимания и готовности, что полиция конечно же будет и помощницу подозревать, но что делать...
Опять смотрим на реакцию.
Ну а далее полиция, покупка сейфа.