Ты знаешь, я бы в твоей ситуации попросила для начала директора (ну или он поручит это кому-то) составить некие внутренние правила, в которых будет четко расписано, что и как разрешается/запрещается, какие необходимо предоставлять документы (заявления, служебные записки и т.д.) в тех или иных случаях. Т.е. если у вас есть такая система, что сотрудники могут работать удаленно, что это может отслеживаться (ну хотя бы присутствие его в сети), то пусть в этих правилах будет прописано, что "сотрудник имеет право работать удаленно в таких-то случаях, при этом он обязан уведомить руководство об этом за такое-то время письменно" либо "сотрудник сам может принимать решение о том, будет ли он работать удаленно или в офисе, при этом нет необходимости уведомлять об этом рук-во заранее". Тогда у тебя будет на руках документ, которым ты сможешь апеллировать в подобных случаях и никто не сможет тебя обвинить в предвзятости - ко всем требования одинаковы, вот они, расписаны в данных правилах.