У нас сначала был порядок - под каждый набор я покупала контейнер, куда складывались запасные части и если помещалась собранная игрушка - то и она тоже. Или игрушка ставилась рядом со своим контейнером на полку. Было удобно, когда собирали, например, наборы 3в1 - взял игрушку, взял относящийся к ней контейнер и пошел собирать.

С недавних пор сын начал креативить, разобрал несколько машинок и давай из кучи получившихся деталей фантазийно что-то собирать свое.
Пособирал-пособирал. Поделки гордо ставил на полки рядом с прочими наборами.

Теперь решил опять собрать все наборы по инструкции. И опаньки - началось постоянное "Мааааам, помоги найти детальку". И вот ищем сначала в общей куче, потом по креативным поделкам нужную детальку.