Глисты по общему анализу видно, к тому аллергией могло проявиться.
Насчет микроэлементов/витаминов... Наверное может так проявится, но ты же не будешь на все них сдавать анализы вслепую? Пусть врач разбирается и назначает дальше.
Попробуй к др. гастроэнкпологу, если все таки в этой сфере видишь проблему.