В новостройке - ты имеешь ввиду на этапе строительства, т.е. до сдачи дома? Тогда сначала оформляешь договор долевого участия (если напрямую у застройщика покупаешь) или договор уступки права требования (если покупаешь у того, кто уже квартиру эту купил у застройщика). Его регистрируют в росреестре. Ждешь, пока дом сдадут. Когда дом сдадут, тебя уведомляют о том, что тебе нужно явиться и принять квартиру. Приезжаешь, если все ок, то подписываешь акт приемки-передачи квартиры. Если нет, то пишешь свои замечания, ждешь, пока их устранят и потом уже подписываешь акт приемки- передачи квартиры. С этим актом, а также с договором (который ты в начале оформила) опять обращаешься в росреестр, оплачиваешь гос.пошлину и ждешь свидетельство о праве собственности :-)
По поводу 13 процентов: тут варианта два: либо получать единовременно через налоговую в годы, следующие за покупкой. Например, купила в 2015 году, доход в 2015 с отчислениями был, в 2016 подаешь декларацию в налоговую и ждешь перечисление уже уплаченных 13 процентов (максимальная сумма - 260 тыс., там еще зависит, в совместной собственности у вас покупка с мужем или нет, тоже есть нюансы). Второй вариант - через работодателя. Обращаешься в налоговую с документами, подтверждающими покупку и твое право на вычет, в течение 30 дней они проверяют твое заявление и выдают подтверждение для работодателя, на основании которого работодатель 13 процентов удерживать не будет, т.е. будет платить тебе з/п целиком (до тех пор, пока 260 тыс. не выплатит). На налоговый вычет можно подавать только тогда, когда есть свидетельство о праве собственности или хотя бы передаточный акт.
Про ипотеку не подскажу.