Я трижды летала с суточной стыковкой, один раз сама багаж захотела забрать, один раз мне его принудительно выдали, один раз до конечной точки зарегистрировали сразу. Причём варианта забрать его на пересадке они не предлагали даже. Так что зависит от авиакомпании и наверное от аэропорта тоже.
Ответ с цитатой