Валерьянки тебе в первую очередь!
Хеликобактер тут вообще при чем?! Про неё вообще забудь сейчас, это совсем другое.
Если педиатр хороший и адекватный, то лучше к нему, все же диету и ферменты он может обозначить, плюс педиатр живот сможет потрогать на предмет вздутия и что там ещё они смотрят. А дальше уже решите, нужен гастроэнтеролог или нет.
А насколько сильно диету нарушили? Сын жалуется на боли в животе?